Počevši sa pregledom glavnih problema koji se tiču podataka o interakcijama između proteina i metoda za obradu ovih podataka, monografija daje prikaz glavnih istraživanja dr Pržulj u polju nalaženja novih, boljih metoda i modela za ove podatke kao i njihovu primenu.
Predstavljene su metode upoređivanja mreža putem grafleta koje je dr Pržulj uvela u svom radu iz 2004. godine. Zatim su predstavljeni novi modeli proteinskih mreža bazirani na geometrijskim grafovima. Prikazan je i algoritam za poravnavanje mreža, kao i njegova primena u rekonstruisanju filogenetskih stabala i predviđanju biološke funkcije proteina za koje se trenutno ne zna šta rade u ćeliji.
Monografija je lepo i pregledno napisana. Svi glavni aspekti u polju analize mreža proteinskih interakcija su pokriveni i relevantne reference su date.
